1.中華民國90年8月1日財政部關稅總局台總政保字第 90600393 號函訂定發布
2.中華民國91年9月4日財政部關稅總局台總局保字第 91105945 號公告修正發布名稱及全文 6  點；並自即日起實施（原名稱：普通及專用保稅倉庫自主管理稽核作業規定）
3.中華民國94年3月10日財政部關稅總局台總局保字第 09410015671號令修正發巾第 1、4、6  點條文；並自九十四年三月十日施行
4.中華民國95年5月55日財政部關稅總局台總局保字第 09510101321  號令修正發布第 4、5 點條文；並自九十五年五月二十二日起施行
5.中華民國95年7月19日財政部關稅總局台總局保字第 09510153581號令修正發布第 6  點條文；並自九十五年七月十九日起施行
6.中華民國99年11月9日財政部關稅總局台總局保字第 09910225841號令修正發布第 6  點條文；並自即日起生效
7.中華民國102年5月24日財政部關務署台關業字第10210110601號令修正發布第3點、第5點；並自即日生效
8.中華民國110年9月11日財政部關務署台關稽字第1101013513號令修正發布