1.中華民國84年4月10日財政部（84）台財關字第 841722930 號令訂定發布全文 16 條
2.中華民國84年11月28日財政部（84）台財關字第 841729102號令修正發布第 8、11、12 條條文；並增訂第 5-1、11-1 條條文
3.中華民國85年10月8日財政部（85）台財關字第 852017686 號令修正發布名稱及全文 19 條（原名稱：快遞貨物進出口通關辦法；新名稱：快遞貨物通關辦法）
4.中華民國85年10月11日關稅總局（85）台總局徵字第 85108667號函修正發布
5.中華民國89年5月17日財政部（89）台財關字第 0890550181 號令修正發布全文 19 條；並自發布日起施行
6.中華民國90年10月18日財政部（90）台財關字第 0900550566 號令修正發布第15條條文
7.中華民國90年12月30日財政部（90）台財關字第 0900550920 號令修正發布全文 28 條；並自發布日施行
8.中華民國92年2月26財政部台財關字第 0920550112 號令修正發布第 6 條條文
9.中華民國94年5月11日財政部台財關字第 09405502150 號令修正發布第 1、10、11、13、15、18、22～27 條條文；並增訂第 11-1條條文
10. 中華民國95年1月5日財政部台財關字第 09405507580 號令修正發布全文 29 條；並自發布日施行
11. 中華民國98年8月10日財政部台財關字第 09805505530 號令修正發布第 5、6、8、10 條條文
12. 中華民國101年12月3日財政部台財關字第 10105536540 號令修正發布第 9 條條文
13. 中華民國103年12月31日財政部台財關字第1031029614號令修正發布名稱及第 2、4、16、17 條條文（原名稱：快遞貨物通關辦法；新名稱：空運快遞貨物通關辦法）
14. 中華民國106年9月25日財政部台財關字第 1061020279 號令修正發布第 10～13、23、25～29 條條文；除第 11 條第 2  項自107年1月1日施行外，其餘自發布日施行
15. 中華民國107年7月11日財政部台財關字第 1071015260 號令修正發布第8條、第10條、第17條及第18條
16. 中華民國108年5月22日財政部台財關字第 10810104933 號令修正發布第17條、第17條之1
17.中華民國109年4月1日財政部台財關字第1091006968號令修正發布第12條
18.中華民國110年4月21日財政部台財關字第1101009945號令修正發布部分條文
19.中華民國111年3月29日財政部台財關字第1111007877號令修正發布第12條之1、第26條、第29條；並自111年4月1日施行
20.中華民國112年2月2日財政部台財關字第1121002008號令修正發布部分條文