法規內容：

一、為配合關稅配額實施辦法及其有關法令之執行，特訂定本作業規定。


二、實施關稅配額之農產品，其配額由財政部委託臺灣銀行股份有限公司
    核配。持有該公司核發之關稅配額證明書者，始得適用配額內稅率。


三、進口人進口取得關稅配額證明書之貨物，報關時應依海關進口稅則（
    以下稱稅則）第九十八章申報稅則號別。


四、進口人進口取得關稅配額證明書之貨物，報關時應於進口報單「輸入
    許可證號碼、項次」欄位申報關稅配額證明書之號碼、項次。


五、申報稅則第九十八章之貨物不得以免審免驗 (c1) 方式通關。


六、事先核配貨物之通關作業如下：
（一）關員應切實核銷業者檢具之書面關稅配額證明書、確認電腦檔資料
      之正確無誤，並應通知該證明書之控管關區進口業務單位核銷海關
      留底聯。
（二）報關時未及檢附關稅配額證明書者，應申報一般稅則號別，俟持憑
      配額證明書並於電腦檔鍵入正確證號、項次後，始得改列稅則第九
      十八章之稅則號別，完稅放行。
（三）進口人未能即時檢具關稅配額證明書而能補正者，得申報納稅辦法
      代碼63，暫列一般稅則，按配額外稅率計算應納關稅之數額繳納保
      證金，申請先行驗放。於證明書有效期間屆滿前補辦手續者，應俟
      補正後於電腦檔鍵入正確證號、項次，並改列稅則第九十八章稅則
      號別；屆期未補辦者，依關稅法第十八條第三項沒入保證金。
（四）繳納保證金待補正關稅配額證明書者，如有其他待決事項，海關應
      立即處理。並於進口人補正關稅配額證明書時儘速結案。
（五）放行後通關資料如有異動，通關單位關員應立即配合修正電腦檔資
      料。但異動涉及關稅配額證明書證號及核銷數量，應先通知該證明
      書控管關區負責單位更正相關資料後，始修正電腦檔資料。
（六）旅客攜帶、郵包寄遞貨物持憑關稅配額證明書申請按配額內稅率課
      徵關稅者，應繕具進口報單並鍵入電腦檔後，再辦理通關。
（七）依稅則第九十八章課徵關稅之農產品，海關電腦依下列方式將配額
      證明書核銷資料傳輸予核配機關（構）：
      1.每日夜間傳輸當日放行貨物之資料及補正關稅配額證明書經改列
        稅則第九十八章並以保證金抵繳結案之案件資料。
      2.傳輸前報單資料如有異動，傳輸最後異動資料。
      3.傳輸後報單資料如有異動，將異動資料併同當時其他放行案件之
        核銷資料傳輸。核配機關（構）應自行區辨並據以更正前已接收
        之核銷資料。


七、申請適用自由貿易協定關稅配額配額內稅率之進口貨物之通關作業如
    下：
（一）與我國簽署自由貿易協定之國家其有關關稅配額部分明定於海關進
      口稅則相關稅則增註。
（二）進口報單第（31）欄第二行應填報相關稅則章別與增註項目，增註
      項目如有適用不同之減稅稅率時，增註項目後加填代號。進口報單
      第（30）欄「輸入許可證號碼、項次」欄位填報「自由貿易協定輸
      入關稅配額證明書」號碼（前兩碼為締約國他方國別代號）。
（三）應於進口報單 CCC  號列附碼填報 PT ，並檢附原產地證明書，其
      號碼填報於進口報單「主管機關指定代號」欄，如不足十四位碼應
      於該號碼之前各空格補填「Ｏ」，以補足十四位碼之規定，以免造
      成錯單。
（四）配額證明書之核銷、控管除財政部另有規定外，按「輸入關稅配額
      證明書」作業方式辦理。
（五）無配額（超過配額數量）者，依第一欄稅率徵稅。