營業人觸犯加值型及非加值型營業稅法（以下簡稱營業稅法）第51條第1項各款，同時違反稅捐稽徵法第44條規定者，依本部85年4月26日台財稅第851903313號函規定，應擇一從重處罰。所稱擇一從重處罰，應依行政罰法第24條第1項規定，就具體個案，按營業稅法第51條第1項所定就漏稅額處最高5倍之罰鍰金額與按稅捐稽徵法第44條所定經查明認定總額處5%之罰鍰金額比較，擇定從重處罰之法據，再依該法據及相關規定予以處罰。
(財政部109年11月3日台財稅字第10904634191號令修正本令援引85年4月26日函釋字號等內容)
(財政部111年9月22日台財稅字第11104644600號令修正本令，配合110年12月17日修正公布稅捐稽徵法第44條第1項規定，將罰鍰計算方式由經查明認定之總額處「5%」修正為「5%以下」，為利判斷擇定從高處罰之法據，爰增列「就經查明認定總額處最高5%之」，以資明確)